Музей истории Томска расположен на Воскресенской горе, по адресу ул. Бакунина, 3.
Музей, расположенный в здании постройки 1859 г., был основан в 1997 г. Для посетителей открылся 7 июня 2003 г. временной экспозицией «Портрет старого Томска». К четырехсотлетию Томска в Музее была подготовлена постоянная экспозиция «Первый век Томска». На ней представлены как уникальные экспонаты XVII века, так и искусно выполненные реконструкции, все это дополнено богатым иллюстративным и текстовым материалом.