Яя — левый приток реки Чулым. Протекает на территории Кемеровской и Томской области, в Томской области по территории Зыряновского, Асиновского и Томского районов. Длина — 319 кв. км., площадь водосбора — 11,58 тыс. кв. км. Исток — в озере к востоку от поселка Яшкино Кемеровская области, устье — впадает в реку Чулым на территории Томской области между Зыряновским и Асино.

Шега́рский райо́н — административно-территориальная единица Томской области, находится в южной части региона, преимущественно на левобережье Оби и по берегам реки Шегарка.
Административный центр — село Мельниково, расположено в 60 км западнее города Томска.

Шайтанка — небольшая речка Обь-Томского междуречья, вытекающая из озера Шайтан на правобережье Оби. Сосновые леса окружают долину реки Шайтанка. Речка с чистой питьевой водой. На реке нет ни единого населённого пункта. В устье реки Шайтанка обнаружено древнее городище, являющееся памятником археологии Томской области.

Чёрная речка (левый приток Томи) — левый приток Томи, берущий своё начало в центре Обь-Томского междуречья. Относится к наиболее крупным рекам междуречья. Протяжённость Чёрной речки до устья — 78 км. Площадь водосбора — 283 км. Густота речной сети в бассейне реки — 0,27 км/км. Высота водосбора — 150 м над уровнем моря, высота устья — 80 м. Устье реки у с.Кафтанчиково.

Чу́зик — река в Парабельском районе Томской области, берёт начало в Васюганских болотах на границе между Томской и Новосибирской областями; течёт на северо-восток, сливаясь с Кёнгой, образует реку Парабель (приток Оби).
Длина 382 км, площадь бассейна 9000 км². Среднемноголетний годовой сток: 30,5 м³/сек, 0,9 км³/год.

Посёлок Чича́г — мелкий населённый пункт (деревня) в Обь-Томском таёжном междуречье, Томский район; в советское время входил в состав поселений Верхнесеченовского сельсовета (Томский округ, Томский район). Ныне не существующая деревня, о которой на географических картах напоминает пометка урочище Чичаг.

Микрорайон Черёмушки — микрорайон и одноимённая остановка общественного транспорта на Иркутском тракте в городе Томске. Административно относится к Октябрьскому району Томска.
Жилая часть микрорайона в основном застроена пятиэтажными «хрущёвками». Образование микрорайона связано преимущественно с ростом оборонного в советское время предприятия Томский приборный завод. Микрорайон располагается в границах улиц: Иркутский тракт — Лазарева — Ивана Черных — Бела Куна.
Смежные микрорайоны: 3-й микрорайон, Жилмассив «Ласточка», 4-й микрорайон, Авангард.

Шегарка — река на севере Новосибирской и юге Томской областей.

Левый приток левой протоки реки Оби — устье (примерные координаты 57°15′18″ с.ш. 84°03′40″ в.д.) находится 11,5 км юго-восточнее райцентра Кривошеино (5.5 км юго-восточнее села Бараново и 7,77 км севернее села Егорово).
Исток (примерные координаты 56°01′23″ с.ш. 81°47′50″ в.д.) расположен в озёрной местности юга Васюганской болотной эко-системы, 120 км северо-восточнее города Каргат, на восточной границе Убинского (западной границе Колыванского) района Новосибирской области, в 30 км южнее границы Томской области — Васюганского заказника.

Озеро Шайтан (Шайтан-озеро) — озеро Томской области, в 7 км на ю-з от посёлка Киреевск, правобережная часть Кожевниковского района.

Чёрная Речка — деревня в Томском районе Томской области. Входит в состав Заречного сельского поселения. Население — 1148 чел. (по данным на 1 января 2010 года). Деревня получил своё название по имени реки Чёрная речка, на которой стоит.